Hicieron ver a los indios que los fenómenos de la naturaleza tienen un origen natural y así quedaban
maravillados cuando se les explicaban los eclipses sirviéndose de naranjas y candelas. Otro tema muy importante fue el de la existencia del más allá, con un cielo y un infierno, cielo al que iban los amigos de Dios, e infierno para los pecadores. Los misioneros describieron el cielo y el infierno con tal viveza que, dado el carácter impresionable de los indios, estos sintieron miedo a su propia idolatría que les conducía al infierno.

Al ser los indios muy aficionados a los ritmos y ceremonias, les encantaba los actos del culto cristiano, como procesiones y sacramentos. La música tuvo un papel fundamental para el aprendizaje de oraciones y textos evangélicos. Las representaciones plásticas del Evangelio, a modo de teatro medieval, sirvieron para explicar las verdades de fe más complicadas. El arte barroco, la imaginería cristiana, los cuadros pintados con fuertes colores, sirvieron como espléndidos catecismos a quienes, no sabiendo leer, se acercaban a Dios por la contemplación y admiración.

Hoy, nos llama la atención la difusión de catecismos impresos en diversas lenguas nativas, dedicados a los indígenas más instruidos, y que fueron un eficaz medio en el aprendizaje de la fe cristiana.

Sin embargo, las exigencias morales del cristianismo resultaron complicados en la práctica. Virtudes como la castidad y la caridad, actitudes como la aceptación de la monogamia o de la indisolubilidad matrimonial fueron algo superior para los indígenas. Será el tiempo quien se encargará de ir corrigiendo lo que ellos entendían como costumbres y los cristianos como pecado.