El Consejo de Asuntos Económicos (CAE) es un órgano especializado que se ocupa, como su propio nombre indica, de los temas relativos a la administración. Como señala el secretario general de la Diócesis de Málaga, Francisco García Villalobos, «está compuesto por técnicos, especialistas en derecho y economía, cuya permanente se reúne mensualmente, y que cumplen un servicio de asesoramiento y control de las distintas inversiones que realiza la Diócesis. El pleno se ocupa, además, de aprobar el balance y los presupuestos anuales».